Подрядчиком стала московская «Специальная научно-реставрационная производственная мастерская», сумма контракта — 752 млн рублей.
Работы включают реставрацию фасадов, иконостасов, крылец, кровли и изразцов, а также благоустройство территории.

Дополнительно «Ярославская художественная мастерская “Реставратор” уже приступила к восстановлению колокольни, Святых ворот и ограды (контракт — 127 млн рублей).

Общий объём финансирования — около 900 млн рублей, средства выделены из федерального бюджета.
Церковь Иоанна Предтечи — уникальный памятник XVII века, единственный пятнадцатиглавый храм России, изображённый на тысячерублевой купюре.